Zatoka Matsalu jest płytka, słonawa i bogata w składniki odżywcze. Jej linia brzegowa pokryta jest żwirem, miejscami błotnista i zarośniętą trzciną. W wielu miejscach znajdują się większe i mniejsze skupiska głazów narzutowych.
Dwór Penij?e jest dobrym punktem wyjścia do spacerów po łąkach i bagnach, do wieży widokowej. To jedno z największych otwartych mokradeł w Europie. W Matsalu zarejestrowano 282 gatunków ptaków, wśród których 175 gniazduje, a 33 bywa przelotem.